Les nouvelles applications pour GPU accélèrent la recherche de médicaments plus efficaces et de matériaux de meilleure qualité
LAMMPS, GROMACS, GAMESS, QMCPACK se hissent au niveau des meilleures applications scientifiques bénéficiant de l’accélération multi-GPU
SANTA CLARA, Californie - 14 novembre 2011 - NVIDIA a annoncé aujourd'hui que les quatre principales applications de modélisation biomoléculaire et de la science des matériaux - LAMMPS, GROMACS, GAMESS et QMCPACK - prennent désormais en charge l'accélération multi-GPU et offrent ainsi des temps de simulation en heures et non plus en jours.
En conséquence, les scientifiques peuvent désormais étudier des modèles moléculaires plus grands pendant des périodes plus longues, avec plus de précision, ce qui conduira à une meilleure connaissance de l'impact potentiel des médicaments et de l'efficacité des nouveaux matériaux. Les développeurs de médicaments pourraient également bénéficier de temps de découverte plus courts et de coûts de développement moindres.
LAMMPS, GROMACS, GAMESS et QMCPACK font désormais partie de la liste d'applications de modélisation scientifique, de plus en plus nombreuses - dont AMBER, NAMD et TeraChem, entre autres -qu'utilisent les chercheurs universitaires, gouvernementaux et industriels pour faire avancer la recherche en misant sur la puissance des GPU.
"La facilité d'accès aux supercalculateurs à base de GPU peu coûteux et peu consommateurs d'énergie a le potentiel d'accélérer le rythme de la recherche scientifique", a déclaré Sumit Gupta, Directeur de Telsa business unit chez NVIDIA. "L'avantage que constitue cette puissance de calcul pour la science est important. Par exemple, les chercheurs parviendront à simuler plus rapidement et plus précisément le comportement biologique des interactions des protéines et des candidats médicaments avant des études animales coûteuses et chronophages ou des essais cliniques."
Les scientifiques engagés dans le recours aux supercalculateurs pour faire progresser la modélisation dans une variété de domaines clés utilisent les quatre applications suivantes :
- GAMESS est une application de chimie quantique importante dans la conception de nouveaux médicaments et matériaux. Elle utilise des méthodes de calcul pour résoudre la structure électronique et les propriétés des molécules.
- GROMACS permet la simulation d'interactions biomoléculaires entre les protéines et les candidats médicaments. Elle peut être utilisée pour étudier le repliement des protéines et celles pliées anormalement, ce qui est pertinent dans la compréhension de maladies comme l'Alzheimer, la maladie de Huntington et certaines formes de cancer.
- LAMMPS est utilisée pour modéliser, à l'échelle atomique, des matériaux à l'état liquide (biomolécules, polymères) ou solide (métaux, semiconducteurs).
- ·QMCPACK simule les propriétés des matériaux, avec une haute précision et une excellente évolutivité grâce à l'aide d’un continuum de méthodes Monte Carlo quantique.
Pour plus d'informations sur les GPU NVIDIA Tesla allez ici .Pour plus d'informations sur l'architecture de NVIDIA CUDA ®, allez là.
